在《Fate/Zero》中，与征服王伊斯坎达尔一同跨越了第四次圣杯战争的少年，韦伯·维尔维特。时光流转，少年继承了君主·埃尔梅罗的称号，以君主·埃尔梅罗Ⅱ世的身份，在魔术师们的总部·时钟塔面临了各种充满神秘的事件——
被周围称作“王子”并被像是少女漫画中男主角那样的地位对待的女生，宵。就在这时，与同样被称作“王子”的市村学长相遇了。不仅被他说“好漂亮”，还在便利店被醉汉缠上时被他所帮助，两人的距离开始急速接近……！
