《五星红旗迎风飘扬2》承接“两弹一星”的故事，从1970年4月我国第一颗人造卫星上天写起，着力塑造毛泽东、周恩来、邓小平等老一辈革命家运筹帷幄，在复杂多变和严峻的国际环境中，审时度势，从容应对，始终立于主动地位。为了维护祖国的主权、领土完整和民族尊严，他们进行的坚定而有理有力的斗争，在严重困难面前，他们带领全国人民，迎难而上，以不屈的姿态和昂扬的精神面貌去战胜和克服困难，终于走出了一条中国特色的社会主义道路。
该剧改编自古风漫画《上国赋之千堆雪》。 罪臣之女玄芊草资质出众，一心想为父平冤，她积极寻找一个强有力的靠山；皇帝私生子尘同雪被太子算计，形势危急，两个各怀心思的人互相接近，相互利用，最终却在一次次同生共死后爱上对方，携手抗敌，为天下百姓谋一个太平盛世。
故事的主人公张海军是一名大陆军官，在一个与世隔绝的地方---月牙岛当连长；孙馥香是一名香港富豪的女儿，就读于北京一所名牌大学。两人在军训中结识。在教官张海军离去的那晚，阿香表明了心迹。但当时张已经有了女朋友。可是没多久，他的女朋友却为了金钱与他分手。而阿香却对他痴心不改。并在毕业后，拒绝长辈安排的一门门当户对的亲事，对方是她的大学同学，一直对他很好。但她却毅然跑回大陆，找到部队，并当着领导的面向海军表明她的决心，表示自己会是一个合格的军嫂。会包容他的缺点，爱护他，尊重他。海军终于被感动。答应交往。 与此同时，海军的前女友竟然阴差阳错般地加给了阿香的父亲（阿香的母亲已经过世多年）。但在她的心底对海军仍然存有感情。但是她是一个贪财的女人。嫁给孙伯父后，又跟孙伯父生意上的朋友---------一名美籍华人勾结在一起。 海军慢慢地爱上了阿香，爱的真诚而炽烈。在阿香第二次去大陆看海军的时候，海军在无意之中看到了她的证件，得知他是香港富豪的独生女儿后，以为中国大陆军人不能跟香港同胞结婚，两人伤心至极。后来找到领导，得到的答案竟然是：政府鼓励大陆军官跟香港同胞联姻。悲极生乐！ 虽然两人情深意重，但是阿香的父亲孙伯父不同意自己的女儿远嫁大陆军人，他有那么大的一份家业需要阿香来继承，他不愿意女儿走那么远。并竭力想把女儿嫁给他的华裔朋友。但是阿香坚决不同意。她又跑到大陆去看海军。父亲和爱人让她左右为难。迫不得已，她提出让海军离开月牙岛，去大城市工作，以他父亲的能力，完全可以办得到。海军不同意。在月牙岛有着落落余辉的大海边，阿香大声说：张海军，你是天底下最大的傻瓜！海军一拳打在身边的石头上，满手是血！ 阿香走了。海军也在母亲的劝说下，开始相亲。但是那些世俗而势力的女人，怎能比的上阿香？每一次相亲，都是无疾而终。在这次阿香离开月牙岛回家的途中，海军送了她。在一条小船上，两人遇到暴风雨的袭击，生死存亡之际，阿香无奈地大喊：老天啊，为什么给我一段这么痛苦的初恋？海军无语。阿香回到家中，被父亲囚禁在一间小屋里。他试图忘记过去，试图按父亲的意思去做，但是她忘不掉张海军。终于，她威胁父亲，如果不同意她去大陆，她就一死了之。父亲无奈，只能放她走。重逢的时候，阿香选了绿色的婚纱，终于携着他心爱的人，在特殊的地方----月牙岛军营，举行了此生难忘的婚礼。 世界上总有那么些可恶的人。在阿香和海军度蜜月的时候，海军的前女友制造的一起车祸，阿香和海军双双受伤入院。不同的是，阿香被送往的香港，而海军被留在大陆的医院治疗。醒来后，这个可恶的女人告诉阿香（阿香不知道他就是海军的前女友）：因为大陆的医疗条件比较差，海军因医治无效死亡了。同时，她又让他以前在大陆的朋友告诉海军：阿香因伤势太重死亡了。 新婚燕尔，却发生这样的悲剧，对于两个相爱甚深的人来说，无疑是致命的打击。阿香和海军在不同的空间里，黯然神伤。一段时间之后，阿香发现自己怀孕了。是海军的骨肉！可是孩子爸爸呢？海军呢？已经永远的离开了他们母子。为了不让孩子一生下来就没有父亲，为了给他一个完整的家，阿香无奈同意了父亲的安排，准备家给那个华裔。婚礼在教堂如期举行，华裔已经说完第三个“我愿意”，但是阿香的最后一个“我愿意”却始终说不出口。直觉告诉他，海军还没死。最起码在没有亲眼看到他的骨灰之前，她不愿意相信这一切都是既定的事实。她脱下婚纱，准备飞往大陆。但是，那个华裔却派来杀手要谋杀她。好不容易逃脱之后，她立即奔赴机场。 阿香来到海军所在城市的已故人员档案馆，查海军的资料，查到了一个同名同姓的，但年龄不符，不是海军！希望在心中燃起！她又来到管辖海军在月牙岛所在连的总部，找曾经帮助过他的那位领导，通信员给她到了一杯水，让她在楼梯转角的椅子上等。然后自己帮她找人去了。 慢慢地，楼梯下走上来一个人，一个军人，一个低着头的军人，一个无精打采、憔悴不堪的军人！没有抬头，只是看着路，慢慢的转过转角，上楼梯。这个身影如此熟悉！这个身影如此亲切！这个身影让人如此魂牵梦绕！“啪！”水杯掉在地上，惊醒的何止两个人！“海军！”梦里无数次泪眼以对，无数次呼喊着的名字，终于响在耳畔。问者慢慢回过头，似乎不敢相信。慢慢地，四目相对，看清了，真的是！任何语言都是多余。拥抱，真真切切的拥抱才能解释一切！这种劫后重生的喜悦。 一年以后，阿香的父亲送她到大陆。阿香手抱孩子，走出机舱，缓缓走向海军。地上，撒落的是月亮的光华。“国泰民安，花好月圆。”一名大校微笑着感叹。一个可爱的小生命从此有了一个美好的名字：张圆圆。
1939年，为打击汪伪政府特务组织76号，军统成立新安特训班。发小陈克海和方黎结伴前往，以期抗日救国。特训班残酷的经历让陈克海看清了军统的真面目。最后一次刺杀任务失败，陈、方二人天各一方。两年后，已秘密加入共产党的陈克海回到上海，卧底潜入76号，发现方黎已经成为76号处长，两兄弟就此踏上截然不同的人生道路。面对性格大变的陈克海，方黎屡次试探，甚至将女特务骆冰安插在陈克海身边。陈克海身处敌营，虎狼环伺，面对一次次的试探与危机，他临危不惧，在党组织的领导下一次次化险为夷，为我党输送了宝贵的情报。同时陈克海的行动将方黎的猜忌推向了极点，这对昔日的同窗知己，在抗日结束后，为了彼此的信仰，将迎来最后的对决。
元婉儿为探寻藏有绝世秘密的天书潜入大唐新新东方书院，与司马清扬意外相识。在一次次的误会与合作中，元婉儿的善良机敏逐渐打动司马，两人暗生情愫。随着不断深入寻找，两人携手解开了天书的秘密也收获了命定爱情。
安墨用祖传古董笔新创作的小说即将完结之时，写作时发生意外，导致小说中的大反派别西君出现在现实世界。在她想方设法把他送回小说的过程中，二人感情逐渐升温，一直人气低迷的她也找到了的自信。然而当她意识到自己爱上别西君之时就必须面对必然的别离。
从小在福利院相识的劳冬冬（韩乐瑶 饰）和姜逸（李若天 饰），因命运弄人而失联。多年后，劳冬冬意外在职场遇到已是CEO的姜逸，却遭其冷遇。一场酒后的诅咒竟令姜逸的公司破产，两人再次相遇，姜逸假扮破产寄居劳冬冬家。沈妍（谭雅月 饰）的归来，带来了新的风波。沈妍误会劳冬冬与姜逸的关系，争执中，宋以明（李泽宇 饰）的介入，使宋以明和沈妍两人渐生情愫。姜逸的真挚行动最终融化了劳冬冬的心。
1941年，某夜。时任日本驻南京派遣军最高长官加藤鹰雄（原名：武藤一郎）来到斧头帮（又名：三联帮）头目黄师爷（原名：黄四）开办的民众乐园夜总会参加开业庆典。并向所谓的南京“社会名流”炫耀“剿灭”南京地下党总部的“战绩”。 而此时，在敌人围剿中，唯一幸存的新晋地下党同志沈念初（化名：王一曼），由于失去了与上级组织的联系，只身潜入夜总。期间，一位神秘人暗中告诉王一曼加藤的所在。王一曼乔装成酒水服务员进入加藤的包房。无意间听到了加藤和美国商人比尔正在谈论石油交易的事宜。原来加藤从中国搜罗了十吨黄金存放在东亚银行，准备私下向美国商人购买石油，用于支持战争消耗。
该剧讲述了检察官钟钦扬和助理检察官宋素，在处理一系列未成年人案件中守护公平正义的故事。与此同时，钟钦扬与高中生李松言结识，逐步厘清当年父母车祸真相，令真凶伏法，众人在正义的暖阳之下，开启崭新的生活。
王家两姐妹自小性格迥异，姐姐王焱患先天性贫血症，妹妹王灵均任性顽劣。王灵均不顾家人反对来到深圳，打破了同在深圳的王焱的看似平静的生活。 失业的王灵均住进了王焱家里，二人的相处从最初的鸡飞狗跳逐渐变得和谐温馨起来，姐妹俩也慢慢收获了属于各自的感情。王焱旧病复发，曾一心想摆脱姐姐的王灵均选择守护在她身边。 在经历了工作和生活风波后，王焱卸下了心理包袱，王灵均也放下了芥蒂，姐妹俩一起开启了新的生活。
蔚蓝一号是一项举世瞩目的科研项目，为此境外间谍机构SAD实施破坏，被沙澎国操控的修罗则希望窃取它的核心技术。国安干警霍敏和队员们瓦解了SAD发起的阴谋、识破了修罗的渗透策略，最终将内鬼和间谍绳之以法。
从小怀揣英雄梦的陈天爽，自体校毕业后，进入国安系统工作。与好兄弟同出任务时，目睹兄弟死在自己眼前。受到心理创伤的他选择离开国安系统，做一个普通的鱼贩。在度过一段平静的日子后，因自身能力过硬，被重召回国安系统。去台湾混入黑帮，并摸清他们的走私渠道。来到台湾后他在“剧本”的加持下披荆斩棘。开启爽文模式的他也迅速融入了当地小镇的生活与人际。可此刻乐观的天爽并不知晓，帮派斗争的惨烈，与卧底任务的残酷，正在不远的未来悄然等待……
