在火星发现的神秘箱子――“潘多拉魔盒”打开的瞬间，巨大的墙壁突然出现！故事由此开始。被称为“天空之墙”的墙壁把日本列岛分割为三部分，并由此诞生了各自的首都「东都」「西都」「北都」。 其中在“东都”有被称为Smash的未确认生命体出现并暗中把人类逼入绝境。挡在Smash面前而出现的，是一位青年，其腰上戴着腰带、 手上握着不可思议的瓶子 。「变身！」―― 青年天才物理学者变身为假面骑士Build，阻挡在Smash的面前！
操纵异形之力的吸血鬼侦探阿尔涅·尼塔特。热爱吸血鬼的名门贵族千金琳·莱茵维斯。本应生活在永无交错的世界中的二人，为解开被血染的谜题而联手。被黑夜笼罩的穷途末路之际，琳迷失在异形者居住的迷之街道·吕根贝尔格。在那里与被称作“最强”吸血鬼阿尔涅的相遇，使少女所生活的世界发生了翻天覆覆地的变化。诡谲怪诞的事件簿，开幕——
