战争之后，日本被分为南北两个部分。美军统治下的青森县，少年藤泽浩纪和白川拓也都喜欢同年级的同学泽度佐由理。他们的心中都有佐由理，还有那个东西——边境以北的津轻海峡，日本北海道联盟建立的高耸云端的“塔”。巨大而神秘的的塔，是三位少年少女的向往，他们约定，建造小型飞机，飞向 塔去一探究竟。中学三年级佐由理转学到东京。两位少年放弃了制造飞机的打算。浩纪考进东京的高中，拓也继续留在青森的高中就学，彼此在各自的道路上越走越远。但是，多年后，佐由理在医院中陷入沉睡！这突如其来的病症让三人再次聚在一起。沉睡的病症，与塔的力量有神秘的联系，而塔本身，似乎也成了日本南北开战的据点。卷入战争与爱情的三人，到底是救佐由理，还是救世界！命运的解答，似乎就在云的那一端，他们曾经约定的地方。

大雄最近有点儿倒霉，在学校因为功课被老师训斥，打棒球技术差被伙伴们嘲笑，房间太乱遭到妈妈责骂。伤心的他异想天开，希望有某种魔法能帮他搞定这一切。在哆啦A梦的“假如电话亭”的帮助下，他们的世界变成了一个魔法的世界，不幸的是大雄依然是最差的那个。与此同时，神秘天体正在接近 地球，魔界之王戴玛奥企图统治世界，他预测到大雄和他的朋友们将是他前进道路上的阻碍，于是他派出魔女美杜沙铲除这些绊脚石。大雄他们遇到了空前的危机……

帝国历486年，年仅19岁的茵哈特·冯·缪杰尔凭借其天才的指挥能力和战斗素养赢得无上荣耀，但同时因为姐姐安妮罗杰是皇帝的宠妃，他也受多许多贵族军官的嘲讽和轻蔑。当茵哈特在上将齐格飞·吉尔菲艾斯的陪同下率领远征军抵达曾经牺牲了数千万人命的伊谢尔伦要塞时，却 被指挥官不顾舟车劳顿，下令命他们前往奈古尼查星迎击同盟军。 在这颗情况复杂的星球，茵哈特再次展现了他出神入化的战场应变能力。五成兵力惨遭歼灭的同盟军指挥官丝毫不承认自己的颟顸，反而率领大批兵力卷土重来。 帝国历486年9月（宇宙历795年9月）第四次提亚马会战拉开序幕，莱因哈特上将率领作为核心的帝国军左翼舰队，即将迎来一场名载史册的传奇战役……

凑家生活的绫香市已经有一年不出现怪兽了。凑家一直过着安稳平静的日子，相比一步步靠近自己梦想的弟弟勇海和妹妹朝阳，哥哥活海陷入了对未来的困惑。于是，活海想见一见自己高中时代的挚友，曾经立志成为游戏制作者的户井。但这位朋友却也是辞了工作宅在家里的状态，这使活海深受打击。谜之存在的托雷基亚借着二人的迷茫用邪恶的力量入侵了两个人封闭的内心。受到影响的活海离开了地球向着怪兽们居住的遥远星球飞去了。为了阻止随后出现在地球的怪兽黑蜧，勇海和从另一个世界到来的小陆分别变身成了布鲁奥特曼和捷德奥特曼迎击。最终家族能否和睦如初，而这个托雷基亚又是何方神圣，目的为何呢！？现在让我们用羁绊之力呼唤奇迹……!

面对生活的诸多不顺的大雄，开始抱怨起现实世界为什么没有魔法。一天，大雄（小原乃梨子 配音）发现了一个哆啦A梦（大山信代 配音）的石像，正打算找出石像的来源，但渴望拥有魔法的大雄，突发奇想到了“如果电话亭”来实现自己的梦想。现实对大雄来说总是很残酷，大雄并没因此而拥有强大的魔力，而且拥有魔毯是一件和奢侈的事情，而大雄家是支付不起的。另外，在这里，科学被视为迷信。著名的魔法研究者满月博士（中村正 配音）告知大家一个可怕的消息：魔界星不过多久便会完全接近地球。大雄想变回现实世界，但是“如果电话亭”早己被妈妈处理掉了。满月博士解读古文书后被捉走，逃亡的美夜子（小山茉美 配音）找到了大雄等人并得到他们的支持，大家一起出发至魔界星，解救博士……本片是哆啦A梦剧场版系类第一次用电脑图形CG绘画。

===Silent Möbius 2 劇場版（下篇）===故事是上一集劇場版的連續，繼續以2024年為背景。母親死後，香津美的心裡未能接受父親的遺產 -『魔法』、母親的死去、平凡生活的完結、及被迫加入AMP等等的事情。一臉怒火地就向AMP等人發泄，卻不得要令。心灰意冷的她意圖放棄自己，卻在這時遇到了生命中的注定的好友 - 彩弧由貴。由貴的熱心支持使她重拾做人的信念，最後接受了自己的命運。