沉香自小被软禁浮仙岛中，由莲藕人陪伴长大，直到灵犀出现，方知事情真相，毅然选择追随灵犀离开，前路坎坷，天庭阻拦，在孙悟空和猪八戒的帮助下，最终集齐念力，召唤宝莲灯，战胜天庭，救得父母，但这所有的一切都只是刚刚开始！

　　南清市缉毒大队队长叶其辉收到卧底警员万蕾线报，本市最大毒贩团伙——“幽灵”组织准备倾销存货，潜逃海外，而与其交易的对象则是K国大毒枭巴青。
　　叶其辉紧急部署抓捕行动，未曾想一切竟是“幽灵”组织为排查卧底特意安排的虚假交易。抓捕行动失败，数名警员牺牲，万蕾陷入险境。
　　通过缜密调查，叶其辉断定“幽灵”组织幕后主脑是彼岸茶餐厅老板——盲女林樱，以及其名义上已经死亡的孪生妹妹林慧。叶其辉立下军令状，三日之后收网，誓将“幽灵”组织和巴青一网打尽，代号“钟馗行动”。
　　另一边，万蕾主动出击，立下投名状，重新获得“幽灵”组织的信任。同时步步为营，深入打探，利用林氏姐妹之间的分歧，以身犯险，独闯“幽灵”组织老巢，凭借苦肉计探查得到“幽灵”组织与巴青交易的具体信息。
　　万蕾冒死传出交易信息，叶其辉迅速部署收网行动。二人里应外合，历经九死一生，成功抓获大毒枭巴青，瓦解林氏双胞胎的“幽灵”组织。叶其辉也终于冲破内心的情感藩篱，在病床前等候万蕾的苏醒。

　　本部电影讲述沉香经历华山之战，结果挚爱殒命也未救出父母，陷入消沉的沉香，在好友的帮助下终重拾信心，踏上寻找开天神斧的路途，然当初华山之战沉香无意破坏了伏魔大阵，误放走了先天心魔，一场三界的劫难即将降临。