神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
金阳原本是一个普通少年，有不少小毛病，但他有十分积极的心态、助人为乐的品格和不怕困难的勇气。一个偶然的机会，他参加了武当山太极学院夏令营，认识了年纪相仿的朱焰、蓝岳等人。校长静虚发给孩子们一些神奇的校徽，据说它与太极能量——元力息息相关。不料，此事被武当的千年对手影山得知。影山尊者发誓夺下武当山，派出手下不断刺探消息，骚扰攻击太极学院。金阳、蓝岳、朱焰等七位少年运用所学的知识，修炼的能量和“千年水滴”赋予的元力，与影山斗智斗勇，大家共同成长，逐步激发了内在的天赋，成为七彩“虹少年”。最终，他们和老师以及校长齐心合力，开启了真虹灵柱的能量，战胜了来犯的影山。
小师爷真名施野，出身于一个师爷家庭，其父为绍兴县府里一名堂堂的师爷。小师爷梦想成为一名顶天立地的师爷，并得到《师爷宝典》。然而，《师爷宝典》蕴含着中华文化的精髓，很多人想得到这本书。老师爷怕大家争夺《师爷宝典》，对小师爷不利，决定不把《师爷宝典》给小师爷。小师爷知道这个消息后，决定用自己的勇气和智慧保护《师爷宝典》。因此，一场《师爷宝典》的争夺战和保卫战开始了。最后，小师爷顺藤摸瓜，用勇气和智慧克服重重困难，最后找到了幕后神秘人，解决危机。
昊天仙帝， 又号“林昊天”,被人陷害轮回后，转世到了大武王朝一名叫做林缺的少年身上。林缺父亲早亡，一家被本家亲戚排斥，不得不搬离家族。虽处境艰难，却并不气馁。带着前世的记忆，林缺踏上了修行之途。修为进展神速，先后击败了圣火教中的赵彪，公孙泰两大高手，随着修为不断上升，无数强者接踵而至，林缺势如破竹，所向披靡！一举成为整个大武王朝最为璀璨的明星！
她被背叛而死，落在了命运相似的少女西凉茉身上，她誓要让伤害她的人付出代价。 步步为营，搅得满城风雨，她终爬到了高处。只是为何那恶贯满盈的太监王爷要强娶她？
在星星球20903年，嚯哈哈回来协助大大怪和小小怪侵略星星球，嚯哈哈学到一个强大的魔法，这个魔法能让星星球日常生活物件的重要部件消失，从而让这个物品不能使用，由此星星球很多东西的重要部件消失，给人们的生活造成了诸多不便，甚至引发了大混乱，为了让人们的生活恢置正常，宅博士带领以开心超人为首的超人们找到了失踪的重要部件，并重新期作出来。在此过程中，超人们知道了生活中一些日常东西运作背后蕴藏的科学道理，再次挫败了大大怪和小小怪的阴谋
